De la monah la episcop al Romei
Agaton s-a născut în Sicilia, într-o familie creștină, și a primit o educație aleasă, potrivit sinaxarului OCA. După moartea părinților, și-ar fi împărțit moștenirea săracilor și a intrat într-o mănăstire. Sursele diferă asupra anului exact al alegerii sale: sinaxarul OCA indică 679, iar cronologia Vaticanului începe pontificatul la 678. Vaticanul datează sfârșitul pontificatului în ianuarie 681, iar OCA dă anul 682; sursele consultate nu explică diferența. Originea siciliană și intervalul aproximativ al pontificatului sunt bine atestate; detaliile despre familie și vârsta sa înaintată provin din tradiții biografice ulterioare.
Sinodul al VI-lea Ecumenic
În timpul păstoririi sale, împăratul Constantin al IV-lea a convocat la Constantinopol Sinodul al III-lea de acolo, cunoscut ca al VI-lea Sinod Ecumenic (680–681). Agaton a trimis o mărturisire de credință și delegați. Sinodul a respins monothelitismul, învățătura potrivit căreia Hristos ar avea o singură voință, și a mărturisit cele două voințe, dumnezeiască și omenească, în unica persoană a lui Hristos. Scrisoarea lui Agaton și răspunsul sinodului sunt păstrate în actele conciliare. El a murit înainte de încheierea lucrărilor sinodului.
Pomenire și reprezentări
Biserica Ortodoxă Română îl pomenește la 20 februarie; în calendarul latin memoria sa este la 10 ianuarie. Galeria arată o miniatură din Menologionul lui Vasile al II-lea, realizat în jurul anului 985, și un medalion mozaicat din seria papilor de la Bazilica Sfântul Pavel din afara zidurilor. Acestea sunt reprezentări ulterioare, nu portrete contemporane.